本棚：人類が消えた世界

今夜のテレビで「人類ZEROの未来！」という番組が放映されていましたが，たぶんそのネタ本です．

人類が突然居なくなったら 地球はどうなるかという想像の世界を描いた本ですが，実際には人類がこれまでどのように環境を変えてきたかということが話の中心になっています．

未来の予想なので科学的な検証が出来るたぐいのものではないのですが，割とまともなことを言っているし，読み物としては面白いかと思います．

インパクトファクター

今年はあまり注意を払っていませんでしたが，MBEの2008年インパクトファクターを見たら10点近くになっていて驚きました．ここ数年で倍になっていますね．

ジャーナルのクオリティ自体は変わっていないと思うので，研究者の層が厚くなったということでしょうか． 同分野の中での位置づけが変わることはないと思いますが，他分野と比べる時には少し張り合いが出るでしょう．

お出かけの予定

ブログのテンプレートがアップデートされていたので変えてみました．古いPCだとつらそうなデザインです．

8月からは学会シーズンとなりますが，今年は8月の進化学会，9月に国際霊長類学会，遺伝学会という順に参加する予定です．お客さんも色々と来る予定なので，暫くは忙しい日が続きそうです．

難産だったがそれもよし

ながいこと揉めていた論文がThe New Phytologistという雑誌にようやく通りました．植物学雑誌の中ではわりと有名なようで，生態から分子まで幅広く扱っています．

Multi-locus analysis of genetic divergence between outcrossing Arabidopsis species: evidence of genome-wide admixture
Wei-Kuang Wang, Chuan-Wen Ho, Kuo-Hsiang Hung, Kuo-Hsiung Wang, Chi-Chun Huang, Hitoshi Araki, Chi-Chuan Hwang, Naoki Osada, Tzen-Yuh Chiang.

内容は他家交配をするArabidopsisの種間交雑の遺伝子解析についてで，長らく台湾のグループと進めてきた共同研究です．使っていたサンプルが台湾にだけいる特別なものだと気付くのに時間がかかり，紆余曲折の末にまとまった感じです．

個人的なポイントとしては，マルチローカスデータから得られた遺伝子系統樹の分布が，種の系統樹と一致するかどうかのexactなテストを開発できたところがあります．Gene flowとincomeplete lineage sortingを分子データから区別するのは難しく，最近論文に書いたサルの雑種の問題のように，2種だけの単純なモデルでもたくさんのデータを使ってヘビーな計算をしなければなりません．種が多い場合にはこういった単純な方法の方が効果的だと思います．

最近の論文はequaly contributedとかco-corresponding authorとかが多く感じます．中国だったかの論文で，3人equal contributionで2人co-correspondingというのも見たことがあります．実はあまり節操がないので好きではないのですが，自分にオファーが来た場合は特に断る理由はありません．来るもの拒まずでco-corresponding authorとなっています．

また，今回の論文で密かな野望が達成されました．シカゴ大学に留学していた時には同じデパートメントに在籍した日本の方に色々とお世話になりました．現在はそれぞれバラバラに研究を続けていますが，分野は同じなので，たまに集まってお互いの研究を知らせ合っています．今回の論文で，3名それぞれと共著を持つことができました．持つべきものは仲間です．

一見不純な動機ですが，統計のBox-Cox検定もBoxさんとCoxさんがノリでコラボレーションしたということですから，そういったノリも案外馬鹿には出来ません．